儿童癫痫属于可治性疾病，其预后也与许多因素有关，如发作类型、病因、起病年龄、发作频率、脑电图改变以及对抗癫痫药物的反应等。不同癫痫发作类型，预后差别较大。
（1）发作类型：儿童期、少年期及青年期的原发性全面性强直汁阵挛发作的预后较好，大部分较易控制，部分性发作的预后以精神运动性发作较差，婴儿痉挛预后最差。
（2）病因：原发性癫痫预后比继发性癫痫好。
（3）起病年龄：儿童癫痫比成人差；起病越早预后越差，1岁以前起病的，发作往往难以控制，预后差；新生儿及婴儿期发生的癫痫，多半具有脑结构的病变，预后较差。
（4）发作频率：持续时间超过半小时的预后较差，癫痫持续状态的死亡率高达20%。发作频率越高，预后越差。
（5）脑电图改变：正常或接近正常的头皮脑电图大多预后良好，异常头皮脑电图中双侧同步放电预后较好。一侧半球异常或弥漫性异常预后则较差，局限性异常预后差，尖慢综合波、局限棘波等预后均差，头皮脑电图定位在顶、枕中央区预后较好，颞和额区预后较差，儿童中颞棘波表示预后好。头皮脑电图和发作之间并不完全一致，头皮脑电图异常的临床发作停止不是预后良好的征象。
（6）治疗早晚：发作在早期得到治疗者预后较好，发病几年后才开始治疗的预后不良。
（7）按疗程服药与否：坚持规律服药、发作控制时间长的强直一阵挛发作，缓慢停药后，复发率最低；局限性发作（运动性）及同时具有几种发作类型者复发率最高。
总体来说，癫痫患儿的平均寿命并没有缩短，但某些已知的脑器质性病变如脑肿瘤、脑穿通畸形、脑萎缩等症状预后差。
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