长期罹患癫痫、发作得不到控制的患者，由于痫样放电导致神经元功能紊乱造成脑组织损害的持续性存在，往往伴发有多种中枢神经系统并发症，其中最常见的就是智力减退或记忆力等认知功能障碍。造成这种并发症的原因除了癫痫疾病本身的损害以外，癫痫患者得不到正常的受教育机会及与社会缺乏交往也是重要的方面。除此之外，运动能力减退、平衡障碍、心理精神异常等也是常见的并发症。
1.智力或认知功能障碍的预防与治疗
应当根据不同的原因进行针对性的预防。大部分癫痫患者认知功能障碍是由于注意力不集中以致学习能力下降，因此失去了信心，自己放弃了学业；或者害怕别人知晓自己罹患癫痫而远离人群，社会知识难以获得。对于这些患者，应积极鼓励他们在条件允许的情况下继续上学或到专门的残障教育机构接受教育，并多使其参与力所能及的社会活动，加强与社会的联系。而对于少部分先天或婴儿早期癫痫导致智力发育障碍的患者，越早在正规康复机构进行针对性的智力康复锻炼，越能够明显的提高患者的智力水平。
2.运动功能及语言障碍的预防与治疗
运动及语言功能是维持人日常生活交往最主要的功能，癫痫患者只要不是发作过于频繁，进行适当的体育活动和力所能及的劳动不仅对身体无害，还能防止废用性的运动功能减退和语言交流能力障碍。如果已经出现了运动和语言功能障碍，一般都说明中枢神经系统内存在明显的器质性病灶，这时应进行详细的检查。如果病灶进一步进展，可以考虑外科手术治疗终止；如果不会，可使用神经生长因子等药物治疗，并进行运动及语言功能康复锻炼。
3.心理精神障碍的预防与治疗
对于罹患癫痫的患者，应对其进行疾病教育，使之了解癫痫治疗的长期性和可治愈性，从而帮助其树立战胜疾病的决心与勇气。同时应对患者进行心理疏导，避免精神压力过大，鼓励其积极参与社会活动。对已出现了精神心理障碍的患者，除加强心理疏导外，还应及时到专门的医疗机构进行药物治疗，必要时可考虑外科手术治疗。
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